内蒙古中蒙医医院成立于1958年，与内蒙古中蒙医研究所合署办公，位于呼和浩特市新城区健康街11号。医院和研究所机构性质均为国家事业单位，医院拨款形式为差额拨款，研究所为全额拨款。就诊患者区域除内蒙古自治区各盟市以外，还包括周边邻近省市如山西省、宁夏回族自治区、甘肃省以及北京、天津等城市。蒙古国政府将医院定为该国“境外唯一信得过医院”。医院(所)职工总数710人，研究所80人，离退休人员272人。卫生技术人员552人，其中高级技术职称112人、中级技术职称265人、初级技术职称258人医院设临床科室35个(中医、蒙医、中西医结合内、外、妇、儿科、防保、康复、急诊、感染、肿瘤、肛肠、骨伤科、针灸、口腔、五官、皮肤科、麻醉、检验、病理、影像科等)。专科专病门诊49个，15个病区，开放病床500张。医院建筑面积：25235M2、固定资产：8758.9万元。业务收入：6718.7万元、财政补助：1606.8万元、门诊量：258531人次、人均门诊费用：96.2元、全年住院患者：9444人次、人均住院费用：5442元。

　　医院始终坚持发挥中蒙医特色和优势，以重点专科带动全院医疗水平的不断提高。国家级重点专科蒙医五疗萨病科根据蒙医药传统理论，总结多年临床经验，研制出治疗萨病(脑血管病)制剂“散普拉I、II、III号”及“萨乌日勒”，并结合蒙医传统“五种疗法”(即针刺、灸疗、推拿、火罐、放血等)，治疗各种脑血管疾病有明显的疗效;国家级重点专科中医心病科研制出“心衰康胶囊”、“七味广枣胶囊”等专科制剂，治疗心力衰竭、心律失常等病症取得满意疗效;自治区重点专科蒙医血液科，通过多年临床实践，研制出“佟拉嘎601”专科制剂，并结合其它蒙医药传统制剂，在治疗血小板减少性紫癜、再生障碍性贫血等血液系统疾病方面，具有独特的疗效。自治区重点专科中医急诊内科采用中西医结合、蒙西医结合等多种临床手段，抢救突发性脑血管疾病、多脏器衰竭等急危重症患者，取得了较好疗效。另外，肛肠科开展无痛、无出血的痔疮PPH手术，并研制了治疗多种肛肠疾病的“痔科I、II号洗剂”，得到患者的一致认可。乳腺病门诊用自制的“慈莲丸”治疗乳腺增生与乳腺纤维瘤;耳鼻喉科用自制的“鼻炎I、II号”治疗慢性鼻炎和过敏性鼻炎;药浴室采用自制的“五味甘露洗剂”，治疗风湿、类风湿及骨关节疾病，均取得了显著疗效;制剂中心结合医院专科专病发展的特点，研制生产出10多种剂型，300多个品种的中蒙药制剂，满足了临床的需要，且专科制剂以其精工细料，品质优良，受到了广大患者的青睐。另外，中蒙医脑病科、呼吸消化科、肿瘤科、耳鼻喉科等也形成了临床特色疗法，研制出多种专科制剂，在临床实践中均取得了良好疗效。制剂中心结合临床各专科专病特点，研制生产出10多种剂型，300多个品种的中蒙药制剂，满足了临床专科专病要求。

　　国家中医药管理局重点专科2个：中医心病科、蒙医五疗萨病科;自治区领先学科2个：中医心病科、蒙医五疗萨病科;自治区重点学科2个：中医急诊科、蒙医血液肿瘤科;自治区重点实验室1个：药理实验室;国家级三级实验室1个：中蒙药分析实验室;国家蒙药制剂中心1个;是国家蒙药教学基地、内蒙古医学院的定点教学与实习医院。2006年，国家中医药管理局对十五重点(专科)中医心病科、蒙医五疗萨病科两个重点专科进行评审验收，并提出评估意见与今后工作的建议。申报国家中医药管理局重点民族医医院建设单位。成立医疗卫生领先(重点)学科建设项目工作领导小组，并成立设备招标采购工作小组。成立蒙医五疗康复中心。

　　编辑出版《中国民族医药杂志》、《内蒙古中医药》、《中国蒙医药》

　　《中国民族医药杂志》系由国家中医药管理局主管、全国中医药图书情报工委会、内蒙古中蒙医研究所主办的我国唯一反映55个少数民族医药的国家级综合性学术期刊，创办于1995年。主要辟有理论探讨、临床报道、诊治经验、方药纵横、疗法应用与研究、试验研究、医苑琐谈、文献研究、教学研究等栏目。本刊理论与实践并举，科研与教学兼顾，涉及面广、信息量大，是广大医药卫生工作者了解、研究、交流我国少数民族医药学的必备期刊。市中国自然科学(遴选)核心期刊;中国学术期刊综合评价数据库来源期刊;《中国期刊网》、《中国学术期刊(光盘版)》全文收录期刊。月刊，80页，大16开本，每册8.00元。国内统一刊号CN15-1175/R,国际标准刊号ISSN1006-6810，国内邮发代号16-94，国外发行代号6501/Q，广告经营许可证：内工商广字1500004000093号。

　　《内蒙古中医药》杂志创刊于1982年，系由内蒙古自治区中医药学会、内蒙古自治区中蒙医研究所主办的综合性中医药学术期刊。本刊立足本区、服务全国、面向基层、注重临床、适宜各级中医、中西医结合工作者学习和交流。本刊主要辟有理论研究、临床报道、临证经验、中西医结合、针灸推拿、疗法与方药、试验研究、文献研究、工艺与制备、护理等栏目。是中国自然科学(遴选)核心期刊，中国学术期刊综合评价数据库来源期刊，《中国期刊网》、《中国学术期刊(光盘版)》全文收录期刊。月刊，64页，大16开本。国内统一刊号CN15-1101/R，国际标准刊号ISSN1006-0979，国内邮发代号16-78，国外发行代号6367/Q

　　《中国蒙医药》(蒙古文版)杂志创刊于1974年，系由中国民族医药学会和内蒙古卫生厅主办、内蒙古自治区中蒙医研究所承办的我国唯一反映中国蒙医药的国家级综合性学术期刊。主要辟有理论探讨、医史研究、试验研究、文献整理、临床报道、诊治经验、外治法、蒙西医结合、方药研究、试验研究、护理、考试指南、教学研究等栏目。本刊理论与实践并举，科研与教学兼顾，涉及面广、信息量大，是广大医药卫生工作者了解、研究、交流我国蒙医药学的必备1期刊。本刊为季刊，80页，大16开本，每册定价5.00元。国内统一刊号CN15-1345/R,国际标准刊号ISSN1006-3854，国内邮发代号16-60，国外发行代号Q6384，广告经营许可证：内工商广字024号

　　医院继续实施人才培养“831工程”，年内共派送名临床医技、护理人员101人次赴北京、天津等地进修学习、交流。延续2005年派送临床科主任赴广东省中医院学习临床管理。接收来自蒙古国、区内进修人员103人次。继续教育12次参加人员430人。

　　医院遵照《院所干部选拔制度》，采取公开、公平的方式，经考试、考核和民主测评，对12名科主任进行了考核聘任;对准备录用的18名中蒙医医疗专业研究生进行了考试、考核、招聘;对36名护理人员进行了理论和实践技能考试、面试、录用。

　　制定医师外出会诊管理规定，推行用药公示制度，开设“济困病房、济困门诊”，并对济困对象的条件进行认定。制定硕士研究生教学培养实施方案，成立15个教研室(蒙医心血管教研室、中医心血管教研室、中医肾病教研室、中医老年病、糖尿病教研室、中医肿瘤教研室、蒙医血液病教研室、中医肺脾病教研室、中医脑病教研室、蒙医脑病教研室、蒙医五疗萨病教研室、中医急症教研室、蒙医老年病教研室、蒙医呼吸消化教研室、功能科教研室、影像教研室)，确定各教研室主任及教研任务。

　　2006年，中标内蒙古自治区自然科学基金科研课题：白音夫主持的“蒙药特色药材黑冰片临床治疗胃肠病依据的实验性研究”;朱德礼主持的“心肌炎康I号治疗病毒性心肌炎基础研究”

　　中标内蒙古卫生厅计划科研项目：乌力吉·特古斯主持的“急性腹泻的蒙医证型规范化及巴特日-7味丸的临床研究”;姚哈斯主持的“蒙医白脉学说在指导针灸临床方面的比较研究”;朱明主持的“蒙药紫檀香研究”。

　　张小平主持的自治区自然基金项目“应用组织芯片及生物分子技术研究我区淋巴瘤病理特点研究”通过自治区科技厅成果鉴定。

　　宋一亭主持的国家自然基金项目“蒙药广枣黄酮(TFC)抗心律失常作用机制的研究”，荣获内蒙古自治区2006年度科技进步三等奖。

　　2006年度，在国家级期刊发表论文45篇、省级期刊发表论文29篇。全年内有82(医疗)人次外出参加短期培训及学术会议。

　　受蒙古国如巴日钦公司邀请，副院长毕力格、院办副主任阿敏乌日图参加了该公司在蒙古国乌兰巴托市召开的“植物化学与蒙药研究论坛会”，为期5天;受卢旺达卫生部邀请，院长苏根元赴卢旺达参观考察;医院与蒙古国司法内务部附属医院续签医疗合作协议，继续实施双方就人才培养、技术合作、参观学习、医药推广、宣传等方面所达成的协议，即医院每年定期为对方医院培养医护人员，提供技术支持与指导;对方对医院在蒙古国进行全面宣传;接收蒙古国进修人员5名;肿瘤科主任耿刚受匈牙利科学院邀请在匈牙利塞格德大学进行学术交流2周;针灸科主任冯木兰以针灸学会委员身份受邀参加第二届国际络病学大会。